Databáze pro medicínu, zdravotnictví a biologii

Zpět na: KISK:Kniha Elektronické informační zdroje (Ondřej Fabián)

Medline

Statistika počtu citací přidaných v jednotlivých letech do databáze Medline. Převzato z dokumentace systému.

Medline je nejznámější světová databáze pro oblast medicíny a příbuzných oborů. Je budována v rámci Národní lékařské knihovny USA. Kromě toho, že slouží jako osvědčený souborný informační zdroj, zahrnuje i dílčí databáze specializované na užší medicínská témata. Předchůdcem systému byl referátový časopis Index Medicus vycházející již od roku 1871. Elektronickou podobu získala databáze v roce 1966. Její jedinečnost podtrhuje i heslář MeSH (http://www.nlm.nih.gov/mesh/), který je používán pro indexaci obsahu databáze a stal se rovněž vedoucím předmětovým selekčním jazykem pro oblast medicíny v celosvětovém měřítku. Databáze používá i CAS Registry Numbers (http://www.cas.org/content/chemical-substances/faqs) pro registraci chemických látek. Vzhledem ke specifické americké informační politice je tento zdroj dostupný přes platformu PubMed zdarma [VLASÁK, 1999]. Stále více je navíc brána v potaz otázka plnotextové dostupnosti obsažených dokumentů. Celá řada materiálů je bezprostředně k dispozici v plnotextové podobě, a to zejména díky iniciativě PubMed Central (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/), která poskytuje volný přístup k velkému množství oborových elektronických časopisů. Kromě toho PubMed nabízí i velmi komfortní linkovací možnosti. V rámci databáze jsou pečlivě vymezovány i citační vazby.

Souhrnné informace:

Producent: The U.S. National Library of Medicine

Počet záznamů: více než 22.000.000

Retrospektiva: od roku 1965, archivní verze od roku 1948

Typ databáze: bibliografický s rostoucí kolekcí plnotextových dokumentů

Způsob přístupu: volně dostupný přes rozhraní PubMed, placený přes databázová centra

Databázová centra s přístupem: Dialog, DIMDI, Ovid, STN International, OCLC, ISI, CSA, ProQuest, Ebsco

Další informace o databázi a přístupu: http://www.nlm.nih.gov/bsd/pmresources.html

Přístup do volně dostupné verze databáze: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

EMBASE

Základní rozhraní databáze na platformě Embase.com. Převzato z dokumentace systému.

Databáze je budována a vlastněna společností Elsevier. Rovněž tento systém je rozdělen na menší tematické kolekce. Vedle medicínských oborů (obzvláště biomedicíny) je z velké části ve fondech zahrnuta i oblast farmacie. Zdrojovou základnu systému tvoří více než 7.600 vědeckých časopisů. Pro věcný popis slouží EMTREE Thesaurus Terms (http://embase.com/info/what-is-embase/emtree), speciální třídění EMCLAS Section Headings a pro chemické látky CAS Registry Numbers. Služba navíc využívá volného přístupu do databáze Medline a přebírá z ní řadu bibliografických záznamů. V kombinaci s originálními záznamy získávánými z unikátních časopisů tak vzniká nejobsáhlejší světový systém pro medicínské obory. Existuje také verze EMBASE Classic, která zpřístupňuje starší záznamy z období 1947-1973, kdy databáze vycházela v podobě referátového časopisu s názvem Excerpta Medica. Přístup do systému je možný kromě webového rozhraní také přes řadu komerčních zprostředkovatelů.

Souhrnné informace:

Producent: Elsevier

Počet záznamů: více než 25.000.000

Retrospektiva: od roku 1974, verze Embase Classic od roku 1947

Typ databáze: bibliografický

Způsob přístupu: placený

Databázová centra s přístupem: Dialog, DIMDI, Ovid, STN International, Lexis/Nexis

Další informace o databázi a přístupu: http://www.info.embase.com/

Bibliographia Medica Čechoslovaca (BMČ)

Záznam v bázi Bibliographia Medica Čechoslovaca. Převzato z www rozhraní systému.

Produkt Národní lékařské knihovny v Praze mapuje literaturu pro oblast medicíny na území České republiky a Slovenska. Od roku 2000 jsou indexovány už pouze české časopisy. Celý systém je provozován jako dílčí báze knihovního systému Aleph, který Národní lékařská knihovna používá. BMČ je součástí portálu Medvik, který integruje řadu lékařských informačních zdrojů „pod jednu střechu“. Do databáze jsou dodávány články z cca 160 titulů časopisů a indexovány jsou rovněž sborníky. Pro zařazování záznamů do databáze a jejich následné vyhledávání se používá heslář MeSH. Databáze obsahuje i starší bibliografické záznamy, které byly do systému doplněny retrokonverzí katalogizačních lístků. Systém je dostupný zdarma a představuje jeden z nejlepších českých informačních produktů. BMČ také tvoří jádro produktu Bibliomedica, který je souborem databází Národní lékařské knihovny standardně dostupným na DVD.

Souhrnné informace:

Producent: Národní lékařská knihovna v Praze

Počet záznamů: zhruba 130.000

Retrospektiva: od roku 1977, verze BMČ s naskenovanými katalogizačními lístky od roku 1947

Typ databáze: bibliografický

Způsob přístupu: volně dostupný

Databázová centra s přístupem: -

Hlavní stránka pro vyhledávání v databázi: http://www.medvik.cz/bmc/

V této souvislosti je třeba zmínit, že vedle oblasti medicínských věd jsou v České republice velmi dobře zpracovány také některé další vědecké obory. Za zmínku určitě stojí alespoň Geografická bibliografie GEOBIBLINE (http://www.geobibline.cz/cs) nebo produkt Ústavu zemědělské ekonomiky a informací zvaný Česká zemědělská a potravinářská bibliografie (http://aleph.uzpi.cz/F/?func=file&file_name=find-b&local_base=uzp02).

Výčet všech českých oborových bibliografických databází naleznete zde: http://www.nkp.cz/pages/page.php3?page=sluz_bb.htm

Systémy Evidence Base Medicine

V poslední době se do popředí dostávají v lékařských vědách systémy zvané Evidence Based Medicine, což jsou služby, které přinášejí informace založené na klinických důkazech. Takovýto informační zdroj poté slouží lékařům k porovnání léčebných metod u konkrétních zdravotních potíží pacientů [PAPÍKOVÁ, 2007]. Odpovědi na otázky jsou obvykle zpracovány v podrobných přehledech a grafech, a to na základě dlouhodobých výzkumů a pozorování. Součástí databází jsou rovněž články z nejkvalitnějších odborných časopisů. Cílem je na základě ověřených informací přispět ke zvolení optimálního způsobu léčby. K předním databázím, které se tomuto tématu věnují, patří Medical Evidence Matters v držení ProQuestu a pak také Evidence-Based Medicine Reviews od společnosti Ovid. Tento zdroj přináší hned sedm dílčích kolekcí, tudíž se zabývá oblastí Evidence Based Medicine velmi komplexně. Se svou službou v podobném duchu přispěchala také společnost Ebsco, která nabízí systém DynaMed, a posledním produktem, který budeme v rámci Evidence Based Medicine systémů jmenovat, je služba UpToDate od stejnojmenné společnosti.

Další informace o databázi a přístupu (Medical Evidence Matters): http://www.ProQuest.co.uk/en-UK/catalogs/databases/detail/evidence_matters.shtml

Další informace o databázi a přístupu (Evidence-Based Medicine Reviews): http://www.ovid.com/site/catalog/DataBase/904.pdf

Další informace o databázi a přístupu (Dynamed): http://dynamed.ebscohost.com/

Další informace o databázi a přístupu (UpToDate): http://www.uptodate.com/index

TOXLINE

Významná databáze pokrývající kompletní oblast toxikologie. Systém je vyvíjen v úzké kooperaci s databází Medline a má i stejného producenta. Uživatel dostává reprezentativní soubor informací z toxikologie i jejich praktických návazností (např. znečištění ovzduší, kontaminace potravin apod.). Databáze obsahuje podrobné bibliografické záznamy dokumentů doplněné o abstrakty a CAS Registry Numbers. Přístup je realizován buď zdarma v rámci portálu TOXNET, nebo přes komerční zprostředkovatelskou společnost Cambridge Scientific Abstracts. Ta ovšem nabízí placený přístup do databáze s kratší retrospektivou, konkrétně od roku 2000.

Souhrnné informace:

Producent: The U.S. National Library of Medicine

Počet záznamů: více než 4.000.000

Retrospektiva: od roku 1980

Typ databáze: bibliografický

Způsob přístupu: volně dostupný

Databázová centra s přístupem: CSA

Další informace o databázi a přístupu: http://www.csa.com/factsheets/toxline-set-c.php

Přístup do volně dostupné verze databáze: http://toxnet.nlm.nih.gov/cgi-bin/sis/htmlgen?TOXLINE

Biosis Previews

Časopisy sledované v databázích Cab Abstracts, Biosis a Web of Science a jejich průniky.

Informační zdroj pokrývající oblasti biologie, ekologie a zčásti i zemědělství a toxikologie. Také proto je část jeho informačního obsahu zahrnuta rovněž ve fondech databází Zoological Record a TOXLINE. Producentem systému je americká nevýdělečná organizace BIOSIS. Databáze excerpuje články z 5.500 časopisů. Pro indexaci používá vlastní předmětové třídění Major Concept Headings and Subheadings a systematické třídění Biosystematic Codes. Využívány jsou i CAS Registry Numbers. Databáze je retrospektivně doplňována. Součástí systému je i řada záznamů z databáze Biological Abstracts.

Souhrnné informace:

Producent: BIOSIS

Počet záznamů: 18.000.000

Retrospektiva: standardní verze od roku 1969, verze Biosis Archive od roku 1926

Typ databáze: bibliografický

Způsob přístupu: placený

Databázová centra s přístupem: Dialog, STN International, Ovid, DIMDI, OCLC, ISI

Další informace o databázi a přístupu: http://scientific.thomson.com/products/bp/

Biological Abstracts

Databáze se zabývá nejen oblastí biologie, ale také širokým spektrem biomedicínských oborů, farmacií, zoologií, botanikou a částečně i zemědělskými vědami. Stejně jako u předchozího zdroje je jejím producentem společnost Biosis. 90 % dokumentů je doplněno o abstrakty. K dispozici je i verze systému, která byla retrospektivně doplněna, a historie nejstarších obsažených záznamů tak sahá až do roku 1926. Existuje rovněž mutace databáze zvaná Biological Abstracts/RRM obsahující záznamy nečlánkového typu (RRM = Reports, Reviews, Meetings). Tato databáze je dostupná výhradně na základě placené licence.

Souhrnné informace:

Producent: BIOSIS

Počet záznamů: 12.000.000

Retrospektiva: standardní verze od roku 1969, verze BA Archive od roku 1926

Typ databáze: bibliografický

Způsob přístupu: placený

Databázová centra s přístupem: Ovid, ISI

Další informace o databázi a přístupu: http://www.ovid.com/site/catalog/DataBase/24.pdf

Další informace o databázi a přístupu (verze RRM): http://thomsonreuters.com/products_services/science/science_products/a-z/biological_abstracts_rrm/

BioOne

Tematické rozvržení časopisů zahrnutých do služby BioOne. Převzato z dokumentace služby.

Tematické rozvržení časopisů zahrnutých do služby BioOne. Převzato z dokumentace služby.

Databáze mapuje oblasti biologie, zoologie, ekologie a dalších příbuzných oborů. Na jejím budování se podílí řada institucí vystupujících pod hlavičkou sdružení BioOne. Vyhledávání je možné v celém obsahu nebo ve třech dílčích kolekcích. Konkrétně jde o BioOne1, BioOne2 a část Open Access, která poskytuje přístup k volně dostupným zdrojům. Bibliografická část databáze, stejně tak přístup k abstraktům, je k dispozici zdarma. Zpoplatněn je pouze přístup k plnotextovým verzím dokumentů. U starších materiálů je přístup k plným textům realizován přes databázi JSTOR. Komerční verzi systému, která je standardně obohacena o plné texty, nabízí i společnost Cambridge Scientific Abstracts. Jak dokládá přiložený výčet, každý tematický obor obsažený v databázi vykazuje určitý podíl impaktovaných titulů. Lze přitom konstatovat, že kvalita zahrnutých žurnálů každoročně stoupá.

Souhrnné informace:

Producent: sdružení BioOne

Počet záznamů: téměř 100.000

Retrospektiva: od roku 1998

Typ databáze: plnotextový

Způsob přístupu: placený, bibliografická verze volně dostupná

Databázová centra s přístupem: CSA

Další informace o databázi a přístupu: http://www.bioone.org/

Zoological Record

Databáze pokrývající zoologii a příbuzné obory je výjimečná zejména svojí retrospektivou datovanou od roku 1864. V minulosti se na tvorbě databáze podílely společnosti BIOSIS a Zoological Association of London, avšak nyní je již systém kompletně v držení společnosti Thomson Reuters. V jeho rámci je monitorováno více než 5.000 klíčových odborných časopisů ze zhruba stovky světových zemí. Každý rok je tak přidáno do databáze více než 70.000 aktuálních bibliografických záznamů. Pro potřeby indexace je využíván speciální ZR Thesaurus, který obsahuje 6.000 deskriptorů. Databáze je dostupná výhradně na placené bázi.

Souhrnné informace:

Producent: Thomson Scientific

Počet záznamů: více než 3.500.000

Retrospektiva: od roku 1864

Typ databáze: bibliografický

Způsob přístupu: placený

Databázová centra s přístupem: Dialog, Ovid, ISI, CSA

Další informace o databázi a přístupu: http://scientific.thomsonreuters.com/products/zr/

Jiným významným zdrojem informací pro oblast zoologie je nesporně produkt společnosti De Gruyter (http://www.degruyter.com/) nazvaný Zoology Online. Jeho tištěný předchůdce Handbuch der Zoologie vychází již více než 100 let. V létě roku 2010 se vydavatelství De Gruyter rozhodlo nabídnout tento zdroj i v elektronické podobě. Informace jsou u starších dokumentů zpřístupněny v němčině, u nových obsahů už dominuje angličtina.

Další informace o databázi a přístupu: http://www.degruyter.com/view/db/zoology