|
|
| Řádek 1: |
Řádek 1: |
| − | '''Autor:''' Michal Létal
| |
| | | | |
| − |
| |
| − |
| |
| − | <span style="font-size:larger">'''Popis práce:'''</span>
| |
| − |
| |
| − | ----
| |
| − |
| |
| − | Bioinformatický analytik (Bioinformatic analyst) spadá do pole bioinformatiky. Bioinformatika využívá nejrůznější nové technologie pro analýzu, modelování a simulaci různých biologických jevů. Také pomáhá při zpracování a následné práci s daty a informacemi získanými z nejrůznějších biologických výzkumů. Bioinformatika propojuje pole biologie, chemie a medicíny s informatikou a informační vědou.
| |
| − |
| |
| − | Občas je tato práce také kombinována s prací Bioinformačního statistika (Bioinformatic statistian) nebo Bioinformačního programátora (Bioinformatic programmer).
| |
| − |
| |
| − |
| |
| − |
| |
| − | <span style="font-size:larger">'''Náplň práce:'''</span>
| |
| − |
| |
| − | ----
| |
| − |
| |
| − | Hlavní náplní práce bioinformačního analytika je vědecky analyzovat a zpracovávat data z bioinformatických výzkumů a projektů. Prezentace a konzultování výsledků těchto zpracování a analýz. Plnění databází daty získanými z výzkumů a udržování aktuálnosti těchto databází. Také konzultace o cílech a směřování dalších výzkumů. V dnešní době jde především o analyzování genetických informací. (např. složitých struktur DNA a RNA).
| |
| − |
| |
| − | <br/>'''<span style="font-size:larger">Povinnosti / Zodpovědnost:</span>'''
| |
| − |
| |
| − | ----
| |
| − |
| |
| − | Bioinformatický analytik může vykonávat nebo mít na starosti některé z těchto procedur a úkolů.
| |
| − |
| |
| − | #Data mining, popis dat a analyzační činnost. Udržování znalostí o příslušné vědecké literatuře, příprava dat a zveřejnění zpráv pro využití jinými vědeckými pracovníky.
| |
| − | #Znát ukazatele kontroly kvality dat a zajistit odpovídající analýzy a zpětné vazby pro odběratele technických údajů.
| |
| − | #Pomoc při návrhu nových experimentů a analyzování dat pro podporu vývoje nových technologií.
| |
| − | #Vývoj algoritmů k integraci profilových dat s jinými typy dat pro biologické analýzy, biomarkery a cíly výzkumu. Práce s různými týmy jako expertní znalec pro podporu programů z různých oblastí.
| |
| − | #Spolupráce s pracovníky pro kontrolu kvality dat a výzkumnými pracovníky k ustanovení norem kvality dat a řízení průběžné analýzy příčin.
| |
| − | #Rozvoj práce s veřejnými zdroji včetně: sbírání a spravování dat z těchto zdrojů, integrace dat genomů s různými typy dat z externích zdrojů.
| |
| − | #Integrovat a analyzovat genomová data ze sekvenční analýzy, funkční analýzy a ostatních druhů podobných analýz
| |
| − | #Návrh a analýza sekvenčních experimentů, genové exprese a genotypizacie ve spolupráci s interními a externími zákazníky.
| |
| − | #Rozvíjení, udržování a analýza metrik kontroly kvality a kontrola kvality databáze genové exprese ke sledování produkce a výskytu a vlivu vad.
| |
| − | #Pomoc pracovníkům Týmu pro udržení kvality dat při vytváření programů pro kontrolu kvality při výrobě a následném udržování těchto programů.<ref>Bioinformatics analyst job description. In: ''HumanResourcer.Hrvinet.com'' [online]. February 15th, 2010 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: http://www.humanresources.hrvinet.com/bioinformatics-analyst-job-description/ </ref>
| |
| − |
| |
| − | <br/><span style="font-size:larger">'''Kariéra:'''</span>
| |
| − |
| |
| − | ----
| |
| − |
| |
| − | Pracovní uplatnění v tomto oboru je široké. Pracovníci mohou pracovat pro výzkumná centra, v soukromém sektoru, na univerzitách nebo ve vládních institucích popřípadě i ve specializovaných nemocnicích. Kariéra v tomto sektoru je velmi perspektivní, protože produkce biologických dat a informací každoročně roste. Podle U. S. Bureau of Labor Statistics má být v období od roku 2008 po rok 2018 nárůst pracovních míst v odvětví Bioinformatiky až o 21%. Bioinformatičtí analytici pracují v průměru 40 hodin týdně, občas musí pracovat i přesčas. Roční průměrný plat v roce 2010 byl v U.S.A. 68 220 $.<ref>Bioinformatics Analyst: Job Duties, Salary and Outlook. In: ''Education-Portal.com'': ''Making Education Accessible'' [online]. © copyright 2003- 2012 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: http://education-portal.com/articles/Bioinformatics_Analyst_Job_Duties_Salary_and_Outlook.html </ref>
| |
| − |
| |
| − | Bioinformační analytici většinou pracují v týmech obklopení dalšími bioinformačními analytiky, bioinformačními statistiky,bioinformačními programátory, biology, chemiky, informatiky nebo doktory. Kariérní růst je možný v rámci těchto týmů. Mnoho institucí má pozice bioinformačních analytiků rozděleny do různých stupňů např. I, II, III nebo klasického rozdělení Junior/Senior. Dále následuje šéf celého týmu/oddělení.
| |
| − |
| |
| − | <br/>'''<span style="font-size:larger">Vzdělání:</span>'''
| |
| − |
| |
| − | ----
| |
| − |
| |
| − | Naprosté minimum pro tuto profesi je Bakalářský titul (Bachelor degree) v oborech jako biologie, molekulární biologie, genetika, biochemie kombinovaný s informatikou nejlepší je ovšem přímo titul v bioinformatice. Většina pracovních nabídek nicméně vyžaduje Magisterský stupeň vzdělání (Master degree) a pro pozice v důležitých a rozsáhlých výzkumech nebo pro vedení týmů musí pracovníci mít ukončené postgraduální studium. Důležitým faktorem je také získaná praxe v oboru, důležitost a výsledky předešlých výzkumů.
| |
| − |
| |
| − | Seznam Univerzit kde se bioinformatika vyučuje: [http://anil.cchmc.org/University.html http://anil.cchmc.org/University.html]
| |
| − |
| |
| − | <br/><span style="font-size:larger">'''Kompetence:'''</span>
| |
| − |
| |
| − | ----
| |
| − |
| |
| − | Bioinformační analytik by měl mít:
| |
| − |
| |
| − | # Alespoň bakalářský titul v přírodovědných oborech, včetně oblastí, jako je biologie, molekulární biologie, genetika, biochemie, a bioinformatika.
| |
| − | #Zkušenosti s prostředím operačních systémů založených na bázi Windows a Unix.
| |
| − | #Zkušenosti se statistickým modelováním a algoritmy pro data mining.
| |
| − | #Zkušenosti se systémy řízení jakosti.
| |
| − | #Znalosti statistiky a různých metod analýzy.
| |
| − | #Znalost Matlabu, Spotfire, SAS, C + +, nebo jiných datově analytických nástrojů.
| |
| − | #Znalost SQL, PERL, Oracle DB, nebo Unix.
| |
| − | #Zvládání práce s velkými objemy dat např. DNA čipy.
| |
| − | #Znalost nových technologií v oblasti práce s genomy.
| |
| − | #Zkušenosti z oblastí Biotechnologií, farmacie a vývoje léčiv.
| |
| − | #Nějakou publikační činnost v oblasti genetiky, bioinformatiky a statistiky.
| |
| − | #Znalost práce v laboratořích genomiky s aplikací v onkologii, léčbě diabetu, léčbě kardiovaskulárních nemocí, léčbě zánětů nebo imunologie.
| |
| − | #Znalost relačních databázových systémů jako Oracle, MySQL, Sybase.
| |
| − | #Schopnost pracovat se softwarem pro analýzu a práci s daty v prostředí Unix.
| |
| − | #Schopnost rychle se učit pracovat s dalšími výpočetními nástroji.
| |
| − | #Silné analytické dovednosti a schopnost řešit rychle a efektivně problémy v rámci působnosti pracovní pozice.
| |
| − | #Mít skvělé komunikační schopnosti ať už v psané nebo písemné formě, výborné prezentační dovednosti a schopnost mezilidské spolupráce.
| |
| − | #Schopnost dokumentovat a popsat různé procesy.<ref>Bioinformatics analyst job specification. In: ''HumanResourcer.Hrvinet.com'' [online]. February 15th, 2010 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: http://www.humanresources.hrvinet.com/bioinformatics-analyst-job-specification/> </ref>
| |
| − |
| |
| − |
| |
| − |
| |
| − | <br/>'''<span style="font-size:larger">Profesní sdružení:</span>'''
| |
| − |
| |
| − | ----
| |
| − |
| |
| − | Bioinformatics Organization
| |
| − |
| |
| − | ''Tato organizace slouží vědeckým a vzdělávacím potřebám bioinformačních odborníků a široké veřejnosti. Zajišťuje a podporuje otevřený přístup k materiálům a metodám potřebným pro výzkum, vývoj a vzdělávání v tomto oboru.''<ref>Bioinformatics Organization. In: Bioinformatics Organization [online]. 16 May 2007, 15 March 2010 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: http://www.bioinformatics.org/wiki/About </ref>
| |
| − |
| |
| − | ISCB
| |
| − |
| |
| − | Zkratka znamená: International Society for Computational Biology. I''SCB slouží k poskytování přístupu k vysoce kvalitním publikacím, pořádáním setkání, a slouží jako portál pro informace o školení, vzdělávání, zaměstnání a poskytování novinek z příbuzných oborů.''<ref>About ISCB. In: ISCB: The Leading Professional Society for the New Era of Computational Biology [online]. Copyright © 2011 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: http://www.iscb.org/iscb-aboutus </ref>
| |
| − |
| |
| − | Czech FOBIA
| |
| − |
| |
| − | Czech Free & Open Bioinformatic asociation. ''Je součástí České společnosti pro biochemii a molekulární biologii (ČSBMB), která sdružuje členy ČSBMB se zájmem o oblast bioinformatiky. Cílem sekce FOBIA je dobrovolné propojení členů ČSBMB se zájmem o oblast bioinformatiky, které by mělo vést k popularizaci bioinformatiky, pořádání přednášek a kurzů pro členy sekce a odbornou veřejnost, snazšímu navazování kontaktů a spoluprací.''<ref>Stanovy sekce CZECH FOBIA ČSBMB. In: Czech FOBIA: Free & Open BioInformatic Association [online]. 7. října 2004 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: http://fobia.img.cas.cz/index.cgi?page=rules&lang=cz </ref>
| |
| − |
| |
| − | <br/><span style="font-size:larger">'''Poznámky:'''</span>
| |
| − |
| |
| − | ----
| |
| − |
| |
| − | <references />
| |
| − |
| |
| − | <span style="font-size: larger">'''Zdroje:'''</span>
| |
| − |
| |
| − | ----
| |
| − |
| |
| − | Bioinformatics analyst job description. In: ''HumanResourcer.Hrvinet.com'' [online]. February 15th, 2010 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: [http://www.humanresources.hrvinet.com/bioinformatics-analyst-job-description/ http://www.humanresources.hrvinet.com/bioinformatics-analyst-job-description/]
| |
| − |
| |
| − | Bioinformatics analyst job specification. In: ''HumanResourcer.Hrvinet.com'' [online]. February 15th, 2010 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: [http://www.humanresources.hrvinet.com/bioinformatics-analyst-job-specification/ http://www.humanresources.hrvinet.com/bioinformatics-analyst-job-specification/]
| |
| − |
| |
| − | PICK, Sarah. Career Tracks in Bioinformatics: A Snapshot of Life as a Bioinformatics Analyst. In: ''Bio Careers®'' [online]. Fri, 2011-03-25 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: [http://biocareers.com/bio-careers-blog/career-tracks-bioinformatics-snapshot-life-bioinformatics-analyst http://biocareers.com/bio-careers-blog/career-tracks-bioinformatics-snapshot-life-bioinformatics-analyst].
| |
| − |
| |
| − | Bioinformatics Analyst: Job Duties, Salary and Outlook. In: ''Education-Portal.com'': ''Making Education Accessible'' [online]. © copyright 2003- 2012 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: [http://education-portal.com/articles/Bioinformatics_Analyst_Job_Duties_Salary_and_Outlook.html http://education-portal.com/articles/Bioinformatics_Analyst_Job_Duties_Salary_and_Outlook.html]
| |
| − |
| |
| − | Bioinformatics Analyst. In: ''HERC'': ''Higer Education Reccruitment Consortium'' [online]. 05/01/2012 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: [http://www.mnyscherc.org/c/job.cfm?site_id=672&jb=10113492 http://www.mnyscherc.org/c/job.cfm?site_id=672&jb=10113492]
| |
| − |
| |
| − | Bioinformatics Analyst. In: ''J. Craig Venter Institute'' [online]. October 2006 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: [https://careers.jcvi.org/careers/Careers.aspx?adata=wmlXLqLyD%2F5leYgbbZ%2BpNLffJ2sE55ejZNQvRZQ6F39SSgufTs%2FaMcf%2FL4x2NRWcoeelcZXB2vNH5fMJgimYSA%3D%3D https://careers.jcvi.org/careers/Careers.aspx?adata=wmlXLqLyD%2F5leYgbbZ%2BpNLffJ2sE55ejZNQvRZQ6F39SSgufTs%2FaMcf%2FL4x2NRWcoeelcZXB2vNH5fMJgimYSA%3D%3D]
| |
| − |
| |
| − | BIOINFORMATICS ORGANIZATION. ''Bioinformatics Organization'' [online]. [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: [http://www.bioinformatics.org/ http://www.bioinformatics.org/]
| |
| − |
| |
| − | CZECH FOBIA. ''Czech FOBIA'': ''Free & Open BioInformatic Association'' [online]. 7. 10. 2004, 21 Sep 2010 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: [http://fobia.img.cas.cz/ http://fobia.img.cas.cz/]
| |
| − |
| |
| − | ISCB: The Leading Professional Society for the New Era of Computational Biology. INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY,. ISCB [online]. Copyright © 2011 [cit. 2012-05-16]. Dostupné z: http://www.iscb.org/
| |
